复旦大学生殖与发育研究院成立于2013年12月，目前是复旦大学二级实体科研机构，现任院长黄荷凤院士。研究院以开展生殖与发育基础研究、技术开发和临床转化为宗旨，依托复旦大学附属妇产科医院、附属儿科医院，与基础医学、生命科学、公共卫生学、临床医学交叉融合，目标建成一流的国家级生殖与发育基础研究平台和转化基地，培养一支具有全球视野和创新能力的国家级人才队伍，实现发育源性/遗传性疾病的机制突破和出生缺陷的源头防控，助力健康中国建设。

研究院团队在国际上创新性地开展配子/胚胎源性疾病的代间/跨代遗传/表观遗传机制；与加拿大、南非、印度联合开展WHO主导的“健康生命轨迹”计划；建立基于孕前-孕期-儿童的社区-家庭-母婴综合干预队列；建立了稳定的基于家系收集-突变基因鉴定-遗传信息解读-胚胎植入前遗传学诊断-胎儿遗传学诊断-新生儿筛查-儿童随访临床体系。“发育源性疾病和遗传性出生缺陷的机制研究和临床精准防控”获2019年度上海市科技进步一等奖和2020年国家科技进步二等奖。

研究院的主要研究方向包括：1、生殖与发育相关基础研究；2、发育源性疾病（包括代谢性疾病、心血管疾病、神经精神性疾病和免疫性疾病等）分子机制研究；3、遗传性出生缺陷的机制及临床转化；4、儿童发育与个体健康。